Конфокальный микроскоп (часто называемый конфокальным лазерным сканирующим микроскопом или CLSM) - это, по сути, импровизированный эпифлуоресцентный микроскоп, который использует лазерный источник для возбуждения флуорофора, в отличие от традиционной ртутной горелки / металлогалогенной лампы / светодиода, используемых в широкоформатном эпифлуоресцентном микроскопе. Однако между конфокальным микроскопом и обычным широкоугольным эпифлуоресцентным микроскопом есть 4 ключевых различия, а именно: (i) механизм сканирования (часто зеркало гальванометра для каждой оси X и Y для сканирования лазерного пятна в поперечном направлении по образцу ), (ii) один или несколько ФЭУ (для обнаружения испускаемой флуоресценции и передачи ее в виде электрических сигналов на подключенный компьютерный терминал в режиме реального времени), (iii) крошечное отверстие (для исключения расфокусированного света) и (iv) неспособность пользователя непосредственно наблюдать конфокальный испускаемый флуоресцентный свет через окуляры микроскопа.